美国冷泉港实验室最新研究：解锁癌症的祖先

知道你的祖先来自哪里是更好的癌症治疗的关键吗？ 也许吧，但是那把钥匙放在哪里呢？ 我们如何将癌症的祖先根源追溯到现代解决方案？ 对于冷泉港实验室 (CSHL) 研究教授亚历山大·克拉斯尼茨 (Alexander Krasnitz) 而言，答案可能深藏于包含数十万个肿瘤样本的庞大数据库和医院档案中。

Krasnitz 和 CSHL 博士后研究员 Pascal Belleau 正在努力揭示癌症与种族或民族之间的系谱联系。 他们开发了新软件，可以从肿瘤 DNA 和 RNA 中准确推断大陆血统。 他们的工作还可以帮助临床医生制定早期癌症检测和个性化治疗的新策略。

“为什么不同种族和民族的人患不同类型癌症的比率不同？” 克拉斯尼茨说。 “他们有不同的习惯、生活条件、暴露——各种社会和环境因素。但也可能有遗传因素。”

Krasnitz 的团队使用混合 DNA 配置文件训练了他们的软件工具。 他们从已知背景的癌变基因组和无关的无癌基因组中创建了这些概况。 然后，他们测试了该软件针对具有已知血统的患者的胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌和血癌标本的性能。 该团队发现该软件将他们的混合档案与大陆人口相匹配，准确率超过 95%。

Krasnitz 说：

“我们有一个很好的模型可以建立，但很少有人来自单一血统。我们在某种程度上都是混合的。所以现在我们正在努力更深入地研究，测试未知血统的肿瘤样本，揭示祖先混合，并实现更多的区域特异性。” 

有多具体？ 现在，想想西非而不是东非。

Krasnitz和Belleau最近与Northwell Health和SUNY Downstate医学中心合作，加入了一项结直肠癌研究。这项研究使他们能够探索结直肠癌是如何根据特定的种族或种族以不同的方式突变基因的。他们希望进一步完善他们的软件，不仅可以推断出整个基因组的祖先，还可以推断出其中的每个个体序列。

Belleau说：

“如果我们能够识别出更多易受不同癌症或其他侵袭性疾病影响的局部祖先，这将有助于我们准确定位基因组的特定部分，并将其用于治疗。”。

现在，一个简单的DNA拭子就能告诉你你来自何处，你将遗传哪些疾病。在未来，它可能会给你打败他们的手段。

参考资料：《Unlocking cancer's ancestry》

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